根据《财政部 税务总局关于增值税法施行后增值税优惠政策衔接事项的公告》（2026年第10号），自2026年1月1日起，一般纳税人购进用于生产或委托加工13%税率货物的农产品，不再享受加计1%扣除进项税额的优惠政策 。这一规定将对企业税负产生重大变化。

一、政策前后对比

核心变化在于农产品深加工企业的进项税额抵扣计算：

1、2025年及以前：购入农产品时先按9%扣除率计算抵扣进项税；生产领用时，再加计抵扣1%，实际总抵扣率为10% 。

2、2026年起：取消加计扣除。无论是否用于深加工，均只能按照购进环节的扣除率（9%）进行抵扣，不再有额外的1% 。

二、对企业税负的影响

1、税负直接增加：以购进100万元农产品为例，原可抵扣10万元（产成品税率13%），现只能抵扣9万元。企业利润表将直接减少1万元，或需多缴相应增值税。

2、影响范围：主要影响以农产品为原料、产成品适用13%增值税率的行业（如食品加工、酿酒、植物油加工等）。

3、特殊提醒：对于实行农产品增值税进项税额核定扣除的企业，由于本身不按“购进+领用”方式计算抵扣，此项政策无影响，需继续关注本省的核定扣除标准 。

三、2026年新政下的合规要点

1. 发票类型与抵扣率：2026年起，一般纳税人购进农产品统一按以下规则抵扣 ：

（1）增值税专用发票（自一般纳税人取得）或海关进口专用缴款书：按发票上注明的税额抵扣。

 （2）小规模纳税人专票（3%征收率）：按发票上注明的金额和9%扣除率计算抵扣。

 （3）农产品销售发票、收购发票：按买价和9%扣除率计算抵扣。

2. 时间节点的确认：严禁对2026年1月1日以后购进的农产品计提1%加计抵减额。若在2026年初对2025年12月属期进行增值税申报（所属期2025年12月），仍可按原政策加计扣除 。

3. 以前年度留抵问题：该政策取消的是“发生购进行为时的加计扣除权利”。对于以前年度结存的库存农产品，只要是在2026年1月1日之前购进且在生产领用环节尚未加计扣除的，应咨询主管税务机关确认是否允许补充扣除（通常需遵循“所属期”原则，严格意义上可能无法追溯）。